Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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