Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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