Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms