Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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