Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms