Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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