Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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