Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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