Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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