Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms