Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms