Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms