Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms