Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG1Q02297 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms