Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDR2Q01850 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms