Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms