Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms