Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMF1P82094 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMF1P82094 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms