Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP46P62068 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP46P62068 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP46P62068 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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