Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 OTOF-201ENST00000272371 7156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ICOSLG-204ENST00000407780 7080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ABCC12-201ENST00000311303 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TMEM258P61165 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms