Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CABP4P57796 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CABP4P57796 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms