Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms