Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AIF1P55008 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms