Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI2P48788 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms