Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1DP48730 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1DP48730 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms