Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms