Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A2P43004 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A2P43004 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC1A2P43004 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms