Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTHFRP42898 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms