Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms