Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms