Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms