Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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