Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms