Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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