Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA6P23229 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms