Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms