Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1P21675 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1P21675 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms