Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DESP17661 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms