Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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