Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB3P14651 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms