Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMP3P12645 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms