Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI2P10070 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI2P10070 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms