Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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