Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms