Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJB6O95452 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms