Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms