Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms