Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms