Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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