Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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LINC00587B1AMM8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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